2021年度研究室配属個別面談，オープンハウス（プロ研A履修検討者も来場可）
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2021年度研究室配属個別面談，および，オープンハウスの案内です
2021年度の研究室配属にあたって，以下のように個別面談とオープンハウスを実施します． 個別面談や，オープンハウスは，プロジェクト研究Aの履修者も参加できますので，お気軽にお越しください．
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Shimizu Lab
近年，膨大な生命情報（特にゲノム配列）が得られるようになり，データ解析の効率化と高度化の必要性が非常に高まっています．本研究室では，ゲノム情報を中心とした，生命情報のデータ解析に必要な新技術の開発に取り組みます. より詳しい情報はこちらから.
We are working on computational biology with the special focus on developing efficient methods for genomic data analysis. See this page for more details.
Keywords: Computational biology, genomics, sequence analysis, next generation sequencing data, algorithms, data structure, machine learning, cryptographic protocol, privacy-preserving data mining
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2020年度プロジェクト研究B
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2020年度プロジェクト研究Bの履修案内です
清水研では生命情報の新しい解析方法を研究しています．
ゲノム解析，文字列検索アルゴリズム，プライバシ保護データマイニングを中心とした様々なテーマがあります．研究の進みは各人の取り組みに依存しますが，過去には学会発表まで達成したケースもあります．
ぜひ履修をご検討ください．（テーマの持ち込みも歓迎します．）
テーマ例：
- 暗号やハードウェアセキュリティ技術を使って，ヒトゲノムデータのプライバシ保護解析アプリを開発してみよう．
- 超高速文字列解析アルゴリズムを理解して実装してみよう．
- ゲノム配列を解析してがんの原因遺伝子を推定してみよう．
- 系統樹分析によってウィルスゲノムの進化を推定してみよう．
2020年度プロジェクト研究A
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2020年度プロジェクト研究Aの履修案内です
清水研では生命情報の新しい解析方法を研究しています．
ゲノム解析，文字列検索アルゴリズム，プライバシ保護データマイニングを中心とした様々なテーマがあります．研究の進みは各人の取り組みに依存しますが，過去には学会発表まで達成したケースもあります．
ぜひ履修をご検討ください．（テーマの持ち込みも歓迎します．）
テーマ例：
- 暗号やハードウェアセキュリティ技術を使って，ヒトゲノムデータのプライバシ保護解析アプリを開発してみよう．
- 超高速文字列解析アルゴリズムを理解して実装してみよう．
- ゲノム配列を解析してがんの原因遺伝子を推定してみよう．
- 系統樹分析によってウィルスゲノムの進化を推定してみよう．
DSB2020@Renne
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2/3-2/5にRenne(France)で開催されたData Structures in Bioinformatics(DSB2020)にて， M1山田が発表を行いました．
発表タイトル：”YATAK: novel reference-free detection of somatic structural variant based on graph-aware index”
2020年 暗号と情報セキュリティシンポジウム@高知
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1/28-31に高知県で開催された2020年 暗号と情報セキュリティシンポジウム(SCIS2020)にて，M2の岩田が発表を行いました．
また、投稿論文に対してSCIS2020論文賞を受賞しました．
発表タイトル：”Intel SGXを用いた個人ゲノム情報解析システム”